Johann Gottfried Frey (* 28. März 1762 in Königsberg (Preußen); † 25. April 1831 in Königsberg (Preußen)) war ein Preußischer Verwaltungsbeamter. Von historischer Bedeutung war er als Mitarbeiter des Heinrich Friedrich Karl vom und zum Stein. Von Frey stammen die Grundlagen der Städteordnung von 1808.